Fundacja Mediatio zajmuje się rozpowszechnianiem i rozwojem mediacji, a także innych metod rozwiązywania sporów w środowisku młodzieżowym. Swoje cele realizuje poprzez prowadzenie postępowań mediacyjnych na terenie Polski, a także poprzez edukowanie społeczeństwa i budowanie pozytywnego wizerunku mediatorów.
Fundacja prowadzi warsztaty w szkołach i organizacjach pozarządowych, a także przygotowuje osoby pracujące z młodzieżą do upowszechniania idei dialogu, wzajemnego zaufania i budowania porozumienia między ludźmi pozostającymi w sporach.