Misją Fundacji jest wspieranie i promowanie wszelkich przedsięwzięć gospodarczych, kulturalnych i oświatowych mających na celu rozwój i aktywizację regionu.
Fundacja Rozwoju Regionu Gołdap przyznaje stypendia uczniom szkół średnich w ramach Gołdapskiego Funduszu Stypendialnego (program "Równe Szanse" Fundacji im. Stefana Batorego).